Viena no Latgales bagātībām ir ezeri. Arī Daugavpils administratīvajā teritorijā kopumā ir 11 ezeri. Lielākais no tiem – Lielais Stopu ezers, kura platība ir vairāk kā 400 hektāru. Jau piecu gadu garumā pilsētas pašvaldība sadarbībā ar Latvijas Zivju fondu īsteno programmu, kuras ietvaros tiek nodrošināta zivju resursu saglabāšana un atjaunošana Lielajā Stropu ezerā, Stropakā, Šuņu ezerā, kā arī citos pilsētas ezeros.